Lab19 DNA Mini prep (plasmid prep) 레시피, 원리 Material SolutionⅠ (50 mM glucose, 25 mM Tris HCl (pH 8.0), 10 mM EDTA (pH 8.0)) Solution Ⅱ (0.2 N NaOH , 1% SDS) Solution Ⅲ (5 M Potassium acetate, Glacial acetic acid) or SolutionⅠ (50 mM Tris HCl (pH 8.0), 10 mM EDTA (pH 8.0)) Solution Ⅱ (0.2 N NaOH , 1% SDS) Solution Ⅲ (3 M Potassium acetate (pH5.5), Glacial acetic acid) Recipe SolutionⅠ Tris base 6.06 g Na2EDTA2H2O 3.72 g in 800 ml dH2O Adj.. 2023. 3. 29. 유전자 재조합 DNA cloning (2) Gibson cloning -HIFI DNA Assembly Gibson cloning 이란? 제한 효소 없이 overlapping ends 를 이용하여 cloning 하는 방법. Strand chew back→ expossing single strand → overlapping ends annealing → 3' extension → Ligation Overlapping ends 만 잘 디자인 하면 여러개의 product로 한번에 insertion 가능하다는 장점이 있다. Gibson cloning을 위해서는 overlapping ends 를 가진 linearize vector 와 insert 가 필요하다. 1. PCR 이 방법은 vector 와 insert 모두 PCR 하는 방법이다. Overlapping region 만 잘 설정하면 된다. 2. Restric.. 2023. 3. 29. 유전자 재조합 DNA cloning (1) Gateway cloning - Entry clone 만들기 1. 원리 bacteriophage λ가 bacteria의 chromosome에 삽입되는 과정의 site-specific recombination이라는 방식을 cloning에 적용. attP (bacteriophage λ) + attB (bacteria) ⇆ attL, attR 1-1. BP cloning Expression vector 에서 혹은 PCR product를 이용하여 Entry clone을 만드는 반응. attB (PCR) + attP (Donor vector) → attR + attL (Entry vector) 25 bp의 attB site를 가진 primer를 이용하여 amplify 된 PCR product를 entry vector 에 넣는다. attB1 5’ – GGGGACAAGTTTG.. 2023. 3. 29. ImageJ macro 사용하기 (2) 변수, 반복 (for loop) ImageJ랑 친해지기 2단계 매크로를 이용한다는 것은 반복작업을 한다는 이야기. 반복 작업을 더욱 쉽게 하는 것은 역시 반복문~ if도 이용하고 하면 좋겠지만 아직 친해지는 중이고 어디까지 친해질 지 모르니까 일단 for 에 관하여 포스팅을 하도록 하겠다. for (initialization; condition; increment) { statement(s) } 위와 같은 형식으로 for loop를 사용할 수 있다. x=7 y="name" for (i=1, i 2021. 7. 22. ImageJ macro 사용하기 (1) 시작하기, Record 이미지 실험은 분석이 중요하다. 보통 이미징 찍는 프로그램으로 분석을 많이 하지만 ImageJ를 이용할 때도 있는데 많은 이미지를 한번에 분석하려면 macro를 이용하면 좋다. 매크로를 이용하는 여러가지 방법 중에는 plugins -> Macros 를 이용하는 방법이 있다. 검색창에 Macro 검색을 해도 된다. 어떤 언어로 이용되는지 처음에는 잘 모르기 때문에 Record를 이용해서 알아보도록 한다. Record를 누르면 Recorder 창이 뜬다. 이 상태에서 반복하고자 하는 일을 하면 기록이 된다. 그것을 바탕으로 조금씩 바꿔서 macro를 짜면 반복적인 작업을 한번에 할 수 있다. 예시 이미지를 하나 불러왔다. 위에 뭐가 한 줄 있었는데 그냥 지워버림. 아무튼 이미지를 하나 불러왔는데 thresh.. 2021. 7. 20. imageJ plugin 설치하기 plugin이란? 프로그램에 추가하는 소프트웨어이다. imagej 에서 다양한 plugin 을 추가하여 사용하면 참 좋다! 여러 사람들이 다양한 plugin 을 만들었고 우리는 설치하면 된다. 보통 사람들이 github에 설치 방법을 설명하고 있다. 이 포스팅에서는 그 중 설치 방법 2가지를 다룬다. 방법 1 1. imageJ에서 menu -> Help -> Updata 2. Manage Update Sites 3. checkboxes 고르기 4. Add Update Site 5. Name -> "" 6. URL -> "" 7. close -> Apply Changes 8. Restart ImageJ 방법 2 1. .jar 파일 다운받기 (.zip 아님) 2. plugins -> Install... 3... 2021. 7. 12. 이전 1 2 3 4 다음
